Исследования перспектив развития различных сфер экономики на региональном уровне основываются на анализе ситуации в конкретной отрасли в общенациональном масштабе.

Эксперты НИЦ Системного анализа участвуют в федеральных проектах по изучению состояния ряда отраслей. Отраслевые разработки также ведутся на уровне отдельных кластеров, организаций и компаний.